آماده سازی مولکول dna کوتاه حاوی شکاف برای دستکاری توسط انبرک نوری

انبرک نوری ابزار جدیدی است که بر اساس برهم کنش نور و ماده کار می کند. این ابزار، امکان دست ورزی زمان- واقعی تک مولکول ها و تک سلول ها را به منظور اندازه گیری برهم کنش های بین آن ها را فراهم می کند. با استفاده از این تله ی نوری می توان ذرّات میکرونی و زیر میکرونی را به دام انداخته و سپس به آن ها نیرو وارد کرد. از آنجا که آگاهی دقیق از میانکنش های منحصر به فرد بین زیست مولکول ها برای فهم بهتر مکانیسم های پیچیده ی درون سلول های زنده ضروری است، توانایی انبرک نوری برای جابه جا کردن تک مولکول ها با دقّت نانومتر و اندازه گیری نیروهای وارد بر آن ها با دقّت فمتونیوتن، توأم با دقّت زمانی میکرو ثانیه، دریچه ی جدیدی برای مطالعات بیوفیزیکی به روی ما گشوده است. هدف این پژوهش، بررسی خواصّ کشسانی مولکول dna کوتاه، با و بدون وجودشکاف تک رشته ای است. یک قطعه ی 1500 جفت بازی از ژنوم انسانی (شامل ژن 5s rrna و نواحی اطراف آن) به کمک واکنش زنجیره ی پلیمراز و با استفاده از آغازگرهای نشان-دار شده در انتهای5’ تکثیر شد. سپس به هر یک از دو انتهای این مولکول یک میکروکره اتّصال داده شد و در نهایت در آزمایش کشش، با استفاده از انبرک نوری تا حدود 25 پیکونیوتن نیروی برشی بر این مولکول اعمال شد.